Auditoría en la que se evalúa la eficacia de un sistema de gestión integrado, esto es, un sistema establecido para cumplir con varias normas o estándares. El ejemplo más común son los sistemas integrados de calidad + medio ambiente.

Las normas que definen los sistemas de gestión normalmente tienen numerosos puntos en común. Esto es una ventaja para las organizaciones que integran sus sistemas de gestión puesto que se aprovecha una misma metodología (por ejemplo la de control de los documentos) para cubrir un requisito similar en varias normas. Las auditorías integradas tienen una filosofía similar, dado que muchos elementos con comunes entre las distintas normas a cumplir por el sistema, esos elementos pueden auditarse una única vez, en lugar de hacerlo para cada una de las normas implantadas. Esto supone una simplificación del proceso de auditoría y un abaratamiento del mismo.